Il Museo ha fin dal suo sorgere (anno 1979) attivato moduli didattici con la preparazione di itinerari naturalistici costituiti da escursioni guidate da esperti naturalisti negli ambienti più significativi della Lunigiana.
Dal 1990 ha allestito in collaborazione con l'Amministrazione Provinciale di Massa Carrara e la Comunità Montana della Lunigiana l'Orto Botanico dei Frignoli. Oggi il Museo offre aule didattiche, veri laboratori per i giovani in cui attraverso specifici programmi è possibile ricevere approfondite spiegazioni, fare esperienze pratiche, prendere confidenza con le più sofisticate apparecchiature scientifiche.
Con la costituzione del Laboratorio di Ecologia del Paesaggio nel 1988, il Museo si pone come struttura leader in Italia nel settore della ecologia dei sistemi ambientali. Una importante stazione di remote sensing e apparecchiature per il G.P.S. (Global Positioning System) consentono la preparazione di Sistemi Geografici lnformatizzati (G.I.S.), l'analisi di immagini da satellite, la predisposizione di banche dati e la loro organizzazione numerica e grafica.
La gestione di banche dati, la preparazione G.I.S., l'elaborazione di dati sperimentali, la catalogazione dei materiali naturalistici, l'analisi spaziale vengono effettuate da software dedicati.
Il Museo è sede della Segreteria internazionale della I.A.L.E. ( lnternational Association for Landscape Ecology ) e della S.I.E.P. (Società Italiana di Ecologia del Paesaggio) curando il coordinamento internazionale di ecologi di oltre trenta nazioni e la organizzazione di corsi universitari di perfezionamento nel campo dell'ecologia dei sistemi ambientali.